Η υπερηχητική εκχύλιση χρησιμοποιείται κυρίως στις βιομηχανίες χυμών και ποτών για την εξαγωγή αποτελεσματικών συστατικών όπως η πηκτίνη και οι φυτικές χρωστικές ουσίες. Η υπερηχητική δόνηση μπορεί να διαπεράσει τα κυτταρικά τοιχώματα των φυτών, επιτρέποντας στην πηκτίνη, τις φυτικές χρωστικές ουσίες και άλλα συστατικά να ρέουν έξω στον χυμό. Ταυτόχρονα, ο υπέρηχος συνεχίζει να εργάζεται για να διασπείρει την πηκτίνη και τα σωματίδια φυτικής χρωστικής σε μικρότερα. Αυτά τα μικρότερα σωματίδια μπορούν να κατανεμηθούν πιο ομοιόμορφα και σταθερά στον χυμό. Η σταθερότητα της υπερηχητικά εκχυλισμένης και ραφιναρισμένης πηκτίνης βελτιώνεται προφανώς. Η έγχυσή της σε χυμούς και ποτά μπορεί να αποτρέψει την καθίζηση και την αποκόλληση των φύλλων. Το χρώμα των φυτικών χρωστικών ουσιών που εκχυλίζονται και ραφινάρονται με υπερήχους είναι πιο έντονο, γεγονός που μπορεί να βελτιώσει σημαντικά το χρώμα των χυμών και των ποτών.